O fluxo de regulação inicia-se nas unidades de saúde do SUS, onde o médico avalia a necessidade de encaminhamento do paciente a uma avaliação especializada. A solicitação é encaminhada à Secretaria Municipal de Saúde (SMS), que cadastra o pedido no sistema informatizado chamado SISREG ou enviada via protocolo via malote, o médico regulador avalia, classifica a solicitação e autoriza o agendamento; conforme a disponibilidade de agenda, a solicitação autorizada é agendada/marcada com base de gravidade e tempo de espera dos procedimentos de responsabilidade municipal.
Procedimentos de responsabilidade estadual o médico regulador avalia, classifica a solicitação, é encaminhada posteriormente ao polo regulador do estado. Onde os médicos profissionais reguladores avaliam, autorizam e classificam a solicitação; conforme a disponibilidade de agenda, a solicitação autorizada é agendada/marcada com base de gravidade e tempo de espera.